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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 爆款披露|乳过酸的逆袭女神兄弟姐妹,衣康过酸绘制球蛋白组强盛归来!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直都在看做煤化工化学工业原料而被知道的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“代谢率废料”称得上“藏宝小分子式”的心路的过程的过程相同,陪你到近几十年才被找到其重要的的微生物基本功能,就此“侧睡农奴把唱歌”,特点是在免疫力慢性炎症病变性皮肤肠道疾病深入分析区域内异彩纷呈。另一个几篇毕业论文曝光了在各种各样慢性炎症病变性皮肤肠道疾病的生物模特中带给衣康酸或其化学工业突显衍微生物的开展益处,并找到其未知靶点。有关衣康酸的“下一世”与“这辈子”,详细推书《乳酸的逆襲兄弟姐妹——衣康酸!这篇跟大家了解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应淡化蛋白酶组学产品,实现1000+玄之又玄度呈现位点检测,稳固逆转传统靶点,全周边所有地方生信进行分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现”到“查证”全步骤业务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验报告流程图

02、实际参数

03、经“点”重演

在测试数据分析中,查出几个参考文献中有关报道的经典之作靶点名词解释衣康酸表达位点,如第1个被发展的衣康酸共价表达核蛋白质酶KEAP1,还在糖酵解径路中的3个核心酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及炎性小体成分核蛋白质酶NLRP3和神经细胞病变环节中的核心核蛋白质酶RIPK3等,其质谱图有以下几点图已知。

04、企业产品优点和缺点

1.重量质控

商务化非特异聊天检则器孵育、SDS-PAGE检则、WB效验、模板关于性分折等供需双位置检则,保证顶目报告正规性。

2.高使用性能质谱设备系统

在Orbitrap Astral全新新一批高判断质谱仪支持下,保持衣康硝化作用突显位点及淀粉酶判定新层次,力助科学技术科学发现了。

3.全的流程一坐式功能

立于拜谱微生物建立完善的工作手机平台,可打造“神经元锻炼→测试探针孵育→WB测量→举重若轻度衣康碱化表达测量→专属密码生信阐述→指定位点PRM核验”全标准流程服务保障,省时省时更可靠。

05、探讨信息内容(地方)

06、app方位

PART 2、文献资料安利

期刊论文一

国外英文题头:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名字微信标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探析信息内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

资料二

英文字母名称:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

实验东西:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、经典案例发展指导思想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备有较为强烈的底物结合在一起实力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康过酸装饰组实际统计数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用表达(方式图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

当做TCA配置中的里头分解分解产生物,衣康酸上下调整分解分解产生、抗体和发炎区间内的能够 用处,为中药疗法抗体发炎性疾患作为了充当中药疗法攻略 。衣康酸组成部分中的亲电性α,β-不饱满羧酸组成部分能对营养物质质上的灵活性半胱氨酸残基来进行烷基化遮盖(迈克尔加持作用),这一项翻譯后遮盖被誉为“衣康酸遮盖(itaconation)”,因而影响到营养物质质功效,调节作用抗体回话和分解分解产生前提条件,为不同疾患制剂创新作为新想法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用表达血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学界绝对的一定量靶向疗法代谢转化组(QMT1000)或电量新陈新陈代谢靶向治疗新陈新陈代谢组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

考生期刊论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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