
近日,沈阳医科学校1、复属医院医生王学浩教授微商团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向药物能力基础代谢检测分析服务。
国外英文大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
常常主题词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主公司:南京医科大学
科学研究素材:细胞
拜谱作为服务项目:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向疗法正能量消化吸收组
技術交通路线:
调查结局
01、YBX1被鉴定结论为HCC中糖酵解的关键所在表观遗传
本研究方案搜集HCC癌症样例(n=7)的单癌生殖内部RNA测序动态数据表格集开展概述,显示糖酵解活力性最主要的低效在癌症癌生殖内部中,hdWGCNA概述辨别出9个表观遗传方案(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的环境模式概述判断YBX1为自己环境模式分险要素(图1H)。进一歩融合IHC、WB实验英文和癌症组织安排开展与紧邻非癌症组织安排开展的室内空间转录组学动态数据表格集声明YBX1是肝癌生殖内部癌医疗的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被敲定为调低HCC细胞系糖酵解的重要性缘由
02、YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点势能新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1通过并增强YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1组合并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷酸性反应,于是催进其核转位
进步论文检测YBX1的O-GlcNAc糖基化是损害其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT可抑药物OSMI-1加工,YBX1核核血清总体质量同质性降底,YBX1磷酸性反应同质性削减(图4A-C)。IP实践体现,在同等的Flag-YBX1底物总体质量下,YBX1-WT的磷酸性反应总体质量同质性如果超过YBX1-T57A,说明磷酸性反应的加强不禁仅是因更高一些的YBX1核核血清理解(图4D)。拆分了核和质多组分看见TMG加工的HCC神经元中YBX1核理解的偏高(图4E-F),进步看见YBX1磷酸性反应的重点调理分子是AKT(图4G-I)。这部分看见重视O-GlcNAc糖基化根据带动其磷酸性反应来提高YBX1核核血清维持性并带动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制有益于其进步骤时有发生磷碱化绘制并可以增进其核转位
05、YBX1有利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1可以淡化PKM2转录
06、YBX1 也能不断提高组蛋清乳硝化作用突显的水平
学习发现了YBX1敲低强势减轻蛋白质酶质乳过酸,需要是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解遏注射剂2-DG的实验操作验证了糖酵解与组蛋白质酶乳过酸的之间绑定,遏制糖酵解可强势减轻H3K18la质量(图6D)。PKM2过表示不可逆转转YBX1敲低造成的H3K18la变低,之外源乳酸处里不提高H3K18la,还伴有YBX1表示上涨,警告出现顺向意见反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la使用聚集于YBX1开始子之间促进会其转录,该过程中受O-GlcNAc糖基化自我调节(图6H-J),高并发现了P300 上涨是YBX1强化H3K18乳酰凝成用的措施(图6K-L)。
图6.YBX1明显增强H3K18乳硝化作用表达技术
内容工作小结
在这些探析中简报了YBX1在HCC中高展示,以及与糖酵破解切涉及到。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,最终得以比较稳定蛋清质并加剧其展示。各种突显还可以淡化YBX1在T57处的磷过酸,可以淡化其核易位。因,某些的过程提高了糖酵解涉及到基因遗传组的转录并激刺乳酸的造成。还有,YBX1激活开通P300的转录,从而win7驱动组蛋清的乳过酸,很大是H3K18la,H3K18乳过酸单向国家宏观调控YBX1基因遗传组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正负极馈环共识机制图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法能源消化吸收组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、译为后淡化组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考资料文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.